Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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