Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESC8

Aff4, AF4/FMR2 family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff4Q9ESC8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms