Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms