Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms