Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Barx1Q9ER42 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Barx1Q9ER42 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Barx1Q9ER42 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Barx1Q9ER42 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Barx1Q9ER42 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Barx1Q9ER42 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Barx1Q9ER42 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Barx1Q9ER42 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Barx1Q9ER42 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Barx1Q9ER42 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms