Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ41

Vmn1r29, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r29Q9EQ41 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Vmn1r29Q9EQ41 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r29Q9EQ41 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Vmn1r29Q9EQ41 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Vmn1r29Q9EQ41 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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