Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms