Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms