Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms