Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 1500004A13Rik-201ENSMUST00000183374 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Gm37932-201ENSMUST00000192258 1167 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 AC153646.1-201ENSMUST00000223229 1279 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 AC164597.1-201ENSMUST00000226538 514 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Anxa10-202ENSMUST00000034054 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Cbx1-203ENSMUST00000093943 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Gm16571-202ENSMUST00000203839 585 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 AC160138.1-201ENSMUST00000217965 588 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Gm43981-201ENSMUST00000203285 1467 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 BB019430-202ENSMUST00000218015 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Bgn-207ENSMUST00000169489 1574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Gm16726-201ENSMUST00000130184 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Gm29277-201ENSMUST00000185226 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Gm29089-201ENSMUST00000186209 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 4930554C24Rik-201ENSMUST00000187735 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Gm44366-201ENSMUST00000204933 674 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Gm44837-201ENSMUST00000206863 717 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 1700063D05Rik-204ENSMUST00000213914 1007 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 AC153528.1-201ENSMUST00000217696 434 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 A430103D13Rik-201ENSMUST00000220077 857 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Olfr1472-202ENSMUST00000096201 1377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Gm45172-201ENSMUST00000206054 1301 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Gabrb2-205ENSMUST00000192403 1539 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Gm25507-201ENSMUST00000116981 144 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms