Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBM0

Abcg8, ATP-binding cassette sub-family G member 8, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg8Q9DBM0 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcg8Q9DBM0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms