Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms