Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB38

Znf580, Zinc finger protein 580, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf580Q9DB38 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
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Znf580Q9DB38 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Znf580Q9DB38 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf580Q9DB38 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Znf580Q9DB38 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Znf580Q9DB38 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf580Q9DB38 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf580Q9DB38 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf580Q9DB38 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf580Q9DB38 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf580Q9DB38 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf580Q9DB38 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf580Q9DB38 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf580Q9DB38 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf580Q9DB38 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf580Q9DB38 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Znf580Q9DB38 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf580Q9DB38 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Znf580Q9DB38 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
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Znf580Q9DB38 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms