Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms