Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB27

Mcts1, Malignant T-cell-amplified sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcts1Q9DB27 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mcts1Q9DB27 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms