Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ift43Q9DA69 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ift43Q9DA69 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ift43Q9DA69 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ift43Q9DA69 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ift43Q9DA69 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ift43Q9DA69 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ift43Q9DA69 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ift43Q9DA69 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ift43Q9DA69 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ift43Q9DA69 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ift43Q9DA69 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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