Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms