Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Snx5Q9D8U8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Snx5Q9D8U8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Snx5Q9D8U8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Snx5Q9D8U8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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