Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Gtf3c6Q9D8P7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms