Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms