Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Ifi35Q9D8C4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms