Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms