Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp4cQ9D7F7 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms