Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srp19Q9D7A6 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srp19Q9D7A6 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Srp19Q9D7A6 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srp19Q9D7A6 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srp19Q9D7A6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srp19Q9D7A6 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srp19Q9D7A6 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Srp19Q9D7A6 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
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Srp19Q9D7A6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Srp19Q9D7A6 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Srp19Q9D7A6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Srp19Q9D7A6 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Srp19Q9D7A6 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Srp19Q9D7A6 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Srp19Q9D7A6 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Srp19Q9D7A6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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