Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms