Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y4

Borcs8, BLOC-1-related complex subunit 8, mousemouse

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Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs8Q9D6Y4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Borcs8Q9D6Y4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Borcs8Q9D6Y4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Borcs8Q9D6Y4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Borcs8Q9D6Y4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Borcs8Q9D6Y4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Borcs8Q9D6Y4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Borcs8Q9D6Y4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Borcs8Q9D6Y4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Borcs8Q9D6Y4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Borcs8Q9D6Y4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Borcs8Q9D6Y4 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Borcs8Q9D6Y4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Borcs8Q9D6Y4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Borcs8Q9D6Y4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Borcs8Q9D6Y4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Borcs8Q9D6Y4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms