Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms