Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

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Length 937 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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Ccdc39Q9D5Y1 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
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Ccdc39Q9D5Y1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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Ccdc39Q9D5Y1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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Ccdc39Q9D5Y1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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Ccdc39Q9D5Y1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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Ccdc39Q9D5Y1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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Ccdc39Q9D5Y1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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Ccdc39Q9D5Y1 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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Ccdc39Q9D5Y1 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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Ccdc39Q9D5Y1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms