Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc105Q9D4K7 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc105Q9D4K7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc105Q9D4K7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc105Q9D4K7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc105Q9D4K7 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc105Q9D4K7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc105Q9D4K7 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc105Q9D4K7 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc105Q9D4K7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc105Q9D4K7 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc105Q9D4K7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc105Q9D4K7 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc105Q9D4K7 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc105Q9D4K7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc105Q9D4K7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc105Q9D4K7 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc105Q9D4K7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc105Q9D4K7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc105Q9D4K7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc105Q9D4K7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc105Q9D4K7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc105Q9D4K7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc105Q9D4K7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc105Q9D4K7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc105Q9D4K7 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc105Q9D4K7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc105Q9D4K7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc105Q9D4K7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc105Q9D4K7 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc105Q9D4K7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc105Q9D4K7 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc105Q9D4K7 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc105Q9D4K7 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc105Q9D4K7 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc105Q9D4K7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc105Q9D4K7 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc105Q9D4K7 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc105Q9D4K7 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc105Q9D4K7 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc105Q9D4K7 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc105Q9D4K7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc105Q9D4K7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc105Q9D4K7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc105Q9D4K7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc105Q9D4K7 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc105Q9D4K7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc105Q9D4K7 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc105Q9D4K7 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc105Q9D4K7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc105Q9D4K7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc105Q9D4K7 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc105Q9D4K7 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc105Q9D4K7 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc105Q9D4K7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc105Q9D4K7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc105Q9D4K7 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc105Q9D4K7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc105Q9D4K7 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc105Q9D4K7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc105Q9D4K7 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc105Q9D4K7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc105Q9D4K7 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc105Q9D4K7 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc105Q9D4K7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc105Q9D4K7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc105Q9D4K7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc105Q9D4K7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc105Q9D4K7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc105Q9D4K7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc105Q9D4K7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc105Q9D4K7 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc105Q9D4K7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc105Q9D4K7 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc105Q9D4K7 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc105Q9D4K7 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc105Q9D4K7 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc105Q9D4K7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc105Q9D4K7 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc105Q9D4K7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc105Q9D4K7 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc105Q9D4K7 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc105Q9D4K7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc105Q9D4K7 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc105Q9D4K7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc105Q9D4K7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc105Q9D4K7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc105Q9D4K7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc105Q9D4K7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc105Q9D4K7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc105Q9D4K7 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc105Q9D4K7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc105Q9D4K7 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc105Q9D4K7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc105Q9D4K7 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc105Q9D4K7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc105Q9D4K7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc105Q9D4K7 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc105Q9D4K7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc105Q9D4K7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms