Protein–RNA interactions for Protein: Q9D304

Rnf128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, mousemouse

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Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf128Q9D304 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rnf128Q9D304 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf128Q9D304 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf128Q9D304 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf128Q9D304 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf128Q9D304 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf128Q9D304 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf128Q9D304 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnf128Q9D304 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnf128Q9D304 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnf128Q9D304 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnf128Q9D304 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnf128Q9D304 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf128Q9D304 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf128Q9D304 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf128Q9D304 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf128Q9D304 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf128Q9D304 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf128Q9D304 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf128Q9D304 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf128Q9D304 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Rnf128Q9D304 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf128Q9D304 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf128Q9D304 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf128Q9D304 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf128Q9D304 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf128Q9D304 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf128Q9D304 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf128Q9D304 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf128Q9D304 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Rnf128Q9D304 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf128Q9D304 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf128Q9D304 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf128Q9D304 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf128Q9D304 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf128Q9D304 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Rnf128Q9D304 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf128Q9D304 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Rnf128Q9D304 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Rnf128Q9D304 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf128Q9D304 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf128Q9D304 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Rnf128Q9D304 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf128Q9D304 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf128Q9D304 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf128Q9D304 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf128Q9D304 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Rnf128Q9D304 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf128Q9D304 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf128Q9D304 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf128Q9D304 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf128Q9D304 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf128Q9D304 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf128Q9D304 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf128Q9D304 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf128Q9D304 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf128Q9D304 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf128Q9D304 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf128Q9D304 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf128Q9D304 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf128Q9D304 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Rnf128Q9D304 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf128Q9D304 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf128Q9D304 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf128Q9D304 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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