Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms