Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Snapc3Q9D2C9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Snapc3Q9D2C9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Snapc3Q9D2C9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Snapc3Q9D2C9 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Snapc3Q9D2C9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Snapc3Q9D2C9 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Snapc3Q9D2C9 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Snapc3Q9D2C9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Snapc3Q9D2C9 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Snapc3Q9D2C9 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Snapc3Q9D2C9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Snapc3Q9D2C9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Snapc3Q9D2C9 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Snapc3Q9D2C9 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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