Protein–RNA interactions for Protein: Q9D275

Batf3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Batf3Q9D275 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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