Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms