Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Sgo1Q9CXH7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
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Sgo1Q9CXH7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Sgo1Q9CXH7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Sgo1Q9CXH7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Sgo1Q9CXH7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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