Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms