Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms