Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUS9

Sppl3, Signal peptide peptidase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl3Q9CUS9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sppl3Q9CUS9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sppl3Q9CUS9 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sppl3Q9CUS9 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sppl3Q9CUS9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sppl3Q9CUS9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sppl3Q9CUS9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sppl3Q9CUS9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sppl3Q9CUS9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sppl3Q9CUS9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sppl3Q9CUS9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sppl3Q9CUS9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sppl3Q9CUS9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sppl3Q9CUS9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sppl3Q9CUS9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sppl3Q9CUS9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sppl3Q9CUS9 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sppl3Q9CUS9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sppl3Q9CUS9 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sppl3Q9CUS9 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sppl3Q9CUS9 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sppl3Q9CUS9 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sppl3Q9CUS9 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sppl3Q9CUS9 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sppl3Q9CUS9 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sppl3Q9CUS9 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sppl3Q9CUS9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sppl3Q9CUS9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sppl3Q9CUS9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms