Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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