Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms