Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PsenenQ9CQR7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PsenenQ9CQR7 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PsenenQ9CQR7 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PsenenQ9CQR7 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PsenenQ9CQR7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PsenenQ9CQR7 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PsenenQ9CQR7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PsenenQ9CQR7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PsenenQ9CQR7 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PsenenQ9CQR7 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PsenenQ9CQR7 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PsenenQ9CQR7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PsenenQ9CQR7 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PsenenQ9CQR7 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PsenenQ9CQR7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PsenenQ9CQR7 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PsenenQ9CQR7 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PsenenQ9CQR7 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PsenenQ9CQR7 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PsenenQ9CQR7 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PsenenQ9CQR7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PsenenQ9CQR7 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PsenenQ9CQR7 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PsenenQ9CQR7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PsenenQ9CQR7 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PsenenQ9CQR7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PsenenQ9CQR7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PsenenQ9CQR7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PsenenQ9CQR7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PsenenQ9CQR7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PsenenQ9CQR7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PsenenQ9CQR7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PsenenQ9CQR7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PsenenQ9CQR7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PsenenQ9CQR7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PsenenQ9CQR7 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PsenenQ9CQR7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PsenenQ9CQR7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PsenenQ9CQR7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PsenenQ9CQR7 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PsenenQ9CQR7 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PsenenQ9CQR7 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PsenenQ9CQR7 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PsenenQ9CQR7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PsenenQ9CQR7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PsenenQ9CQR7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PsenenQ9CQR7 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PsenenQ9CQR7 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PsenenQ9CQR7 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PsenenQ9CQR7 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PsenenQ9CQR7 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PsenenQ9CQR7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PsenenQ9CQR7 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PsenenQ9CQR7 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PsenenQ9CQR7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PsenenQ9CQR7 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PsenenQ9CQR7 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms