Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms