Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Mrpl35Q9CQL6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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