Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd2aQ9CQJ1 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd2aQ9CQJ1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd2aQ9CQJ1 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd2aQ9CQJ1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd2aQ9CQJ1 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd2aQ9CQJ1 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd2aQ9CQJ1 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd2aQ9CQJ1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd2aQ9CQJ1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd2aQ9CQJ1 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd2aQ9CQJ1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd2aQ9CQJ1 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd2aQ9CQJ1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd2aQ9CQJ1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd2aQ9CQJ1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd2aQ9CQJ1 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd2aQ9CQJ1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd2aQ9CQJ1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd2aQ9CQJ1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd2aQ9CQJ1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd2aQ9CQJ1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd2aQ9CQJ1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd2aQ9CQJ1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd2aQ9CQJ1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd2aQ9CQJ1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd2aQ9CQJ1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd2aQ9CQJ1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd2aQ9CQJ1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd2aQ9CQJ1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd2aQ9CQJ1 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd2aQ9CQJ1 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd2aQ9CQJ1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd2aQ9CQJ1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd2aQ9CQJ1 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd2aQ9CQJ1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd2aQ9CQJ1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd2aQ9CQJ1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd2aQ9CQJ1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd2aQ9CQJ1 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd2aQ9CQJ1 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd2aQ9CQJ1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd2aQ9CQJ1 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd2aQ9CQJ1 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd2aQ9CQJ1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd2aQ9CQJ1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd2aQ9CQJ1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd2aQ9CQJ1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Higd2aQ9CQJ1 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Higd2aQ9CQJ1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd2aQ9CQJ1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd2aQ9CQJ1 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd2aQ9CQJ1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd2aQ9CQJ1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd2aQ9CQJ1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd2aQ9CQJ1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd2aQ9CQJ1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd2aQ9CQJ1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd2aQ9CQJ1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd2aQ9CQJ1 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd2aQ9CQJ1 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd2aQ9CQJ1 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd2aQ9CQJ1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd2aQ9CQJ1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd2aQ9CQJ1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd2aQ9CQJ1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd2aQ9CQJ1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd2aQ9CQJ1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd2aQ9CQJ1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd2aQ9CQJ1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd2aQ9CQJ1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd2aQ9CQJ1 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd2aQ9CQJ1 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd2aQ9CQJ1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd2aQ9CQJ1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd2aQ9CQJ1 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd2aQ9CQJ1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd2aQ9CQJ1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd2aQ9CQJ1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd2aQ9CQJ1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd2aQ9CQJ1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd2aQ9CQJ1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd2aQ9CQJ1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd2aQ9CQJ1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd2aQ9CQJ1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd2aQ9CQJ1 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd2aQ9CQJ1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd2aQ9CQJ1 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd2aQ9CQJ1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd2aQ9CQJ1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd2aQ9CQJ1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd2aQ9CQJ1 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd2aQ9CQJ1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd2aQ9CQJ1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd2aQ9CQJ1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd2aQ9CQJ1 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd2aQ9CQJ1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd2aQ9CQJ1 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd2aQ9CQJ1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd2aQ9CQJ1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms