Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Atp6v0e1Q9CQD8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Atp6v0e1Q9CQD8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Atp6v0e1Q9CQD8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Atp6v0e1Q9CQD8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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