Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms