Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ45

Nenf, Neudesin, mousemouse

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NenfQ9CQ45 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NenfQ9CQ45 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NenfQ9CQ45 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NenfQ9CQ45 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NenfQ9CQ45 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NenfQ9CQ45 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NenfQ9CQ45 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NenfQ9CQ45 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NenfQ9CQ45 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NenfQ9CQ45 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NenfQ9CQ45 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NenfQ9CQ45 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NenfQ9CQ45 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NenfQ9CQ45 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NenfQ9CQ45 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NenfQ9CQ45 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NenfQ9CQ45 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NenfQ9CQ45 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NenfQ9CQ45 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NenfQ9CQ45 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NenfQ9CQ45 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NenfQ9CQ45 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NenfQ9CQ45 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NenfQ9CQ45 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NenfQ9CQ45 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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NenfQ9CQ45 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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NenfQ9CQ45 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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NenfQ9CQ45 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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NenfQ9CQ45 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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NenfQ9CQ45 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NenfQ9CQ45 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms