Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms