Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms