Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms